MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	TTA	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	TTAA	2	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010470	AAATA	2	10	61	70	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010470	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	170016309
5	NC_010470	TCG	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
6	NC_010470	GA	3	6	116	121	50 %	0 %	50 %	0 %	170016309
7	NC_010470	TA	3	6	140	145	50 %	50 %	0 %	0 %	170016309
8	NC_010470	AGC	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
9	NC_010470	AGT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
10	NC_010470	AGT	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
11	NC_010470	AGT	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
12	NC_010470	AGT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
13	NC_010470	AGT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
14	NC_010470	AGT	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
15	NC_010470	AGT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
16	NC_010470	AGT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
17	NC_010470	AGT	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
18	NC_010470	AGT	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
19	NC_010470	AGT	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
20	NC_010470	AGT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
21	NC_010470	GCAGT	2	10	803	812	20 %	20 %	40 %	20 %	170016309
22	NC_010470	AGT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
23	NC_010470	AGT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
24	NC_010470	AGT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
25	NC_010470	GCAGT	2	10	920	929	20 %	20 %	40 %	20 %	170016309
26	NC_010470	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
27	NC_010470	GCAA	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	170016309
28	NC_010470	TGG	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
29	NC_010470	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	170016309
30	NC_010470	CTG	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
31	NC_010470	TAT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
32	NC_010470	ATG	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
33	NC_010470	ATA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
34	NC_010470	ACT	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
35	NC_010470	CA	3	6	1437	1442	50 %	0 %	0 %	50 %	170016309
36	NC_010470	AAC	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
37	NC_010470	TTA	2	6	1449	1454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
38	NC_010470	CAAA	2	8	1470	1477	75 %	0 %	0 %	25 %	170016309
39	NC_010470	TGC	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
40	NC_010470	ACG	2	6	1543	1548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
41	NC_010470	TGT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
42	NC_010470	ATG	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
43	NC_010470	AGT	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
44	NC_010470	TTAC	2	8	1670	1677	25 %	50 %	0 %	25 %	170016309
45	NC_010470	GAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
46	NC_010470	AT	3	6	1818	1823	50 %	50 %	0 %	0 %	170016309
47	NC_010470	ACA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
48	NC_010470	CAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
49	NC_010470	CTA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
50	NC_010470	TA	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	170016309
51	NC_010470	GAT	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
52	NC_010470	CCA	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016309
53	NC_010470	CAG	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
54	NC_010470	AAG	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
55	NC_010470	TGA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
56	NC_010470	AAC	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
57	NC_010470	CAG	2	6	2279	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
58	NC_010470	AAT	2	6	2299	2304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
59	NC_010470	CAAT	2	8	2390	2397	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
60	NC_010470	GTG	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
61	NC_010470	AAC	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
62	NC_010470	GTT	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
63	NC_010470	GTG	2	6	2641	2646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
64	NC_010470	CAG	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
65	NC_010470	AGT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
66	NC_010470	CAG	2	6	2954	2959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
67	NC_010470	AAG	2	6	2966	2971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
68	NC_010470	TGA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
69	NC_010470	AAC	2	6	3033	3038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
70	NC_010470	CAG	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
71	NC_010470	AAT	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
72	NC_010470	CAAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
73	NC_010470	GTG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
74	NC_010470	AAC	2	6	3426	3431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
75	NC_010470	GTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
76	NC_010470	GTG	2	6	3484	3489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
77	NC_010470	CAG	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
78	NC_010470	AGT	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
79	NC_010470	CAG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
80	NC_010470	AAG	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
81	NC_010470	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
82	NC_010470	AAC	2	6	3876	3881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
83	NC_010470	CAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
84	NC_010470	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
85	NC_010470	CAAT	2	8	4076	4083	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
86	NC_010470	GTG	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
87	NC_010470	AAC	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
88	NC_010470	GTT	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
89	NC_010470	GTG	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
90	NC_010470	CAG	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
91	NC_010470	AGT	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
92	NC_010470	CAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
93	NC_010470	AAG	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
94	NC_010470	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
95	NC_010470	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
96	NC_010470	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
97	NC_010470	AAT	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
98	NC_010470	CAAT	2	8	4919	4926	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
99	NC_010470	GTG	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
100	NC_010470	AAC	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
101	NC_010470	GTT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
102	NC_010470	GTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
103	NC_010470	CAG	2	6	5234	5239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
104	NC_010470	AGT	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
105	NC_010470	CAG	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
106	NC_010470	AAG	2	6	5495	5500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
107	NC_010470	TGA	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
108	NC_010470	AAC	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
109	NC_010470	CAG	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
110	NC_010470	AAT	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
111	NC_010470	CAAT	2	8	5762	5769	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
112	NC_010470	CAA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
113	NC_010470	AGC	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
114	NC_010470	CTA	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
115	NC_010470	CAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
116	NC_010470	TTA	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
117	NC_010470	AGT	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
118	NC_010470	GAT	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010470	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010470	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010470	GATT	2	8	6244	6251	25 %	50 %	25 %	0 %	170016310
122	NC_010470	TAATT	2	10	6257	6266	40 %	60 %	0 %	0 %	170016310
123	NC_010470	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016310
124	NC_010470	GTT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016310
125	NC_010470	AG	3	6	6329	6334	50 %	0 %	50 %	0 %	170016310
126	NC_010470	CAA	2	6	6432	6437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016310
127	NC_010470	AGTA	2	8	6467	6474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010470	TAAA	2	8	6489	6496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010470	TGAAG	2	10	6543	6552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010470	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010470	AAT	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010470	T	6	6	6684	6689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010470	AT	3	6	6690	6695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010470	TAGA	2	8	6711	6718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010470	T	7	7	6754	6760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_010470	CTA	2	6	13296	13301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016325
274	NC_010470	TTG	2	6	13532	13537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016326
275	NC_010470	AAT	2	6	13578	13583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016326
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277	NC_010470	TCA	2	6	13588	13593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016326
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282	NC_010470	TGG	2	6	13785	13790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016326
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288	NC_010470	AAT	2	6	13944	13949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016326
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294	NC_010470	TA	4	8	14287	14294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_010470	AT	3	6	14296	14301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010470	TTGAT	2	10	14347	14356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010470	TA	4	8	14413	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_010470	AT	3	6	14432	14437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_010470	TGT	2	6	14468	14473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_010470	TAT	2	6	14595	14600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_010470	TGT	2	6	14616	14621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_010470	T	7	7	14951	14957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_010470	GTTT	2	8	15051	15058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
316	NC_010470	T	7	7	15067	15073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_010470	TTGT	2	8	15144	15151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_010470	A	7	7	16514	16520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_010470	TTTA	2	8	18448	18455	25 %	75 %	0 %	0 %	170016332
407	NC_010470	TGG	2	6	18469	18474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016332
408	NC_010470	TATTGG	2	12	18495	18506	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	170016332
409	NC_010470	ATT	2	6	18586	18591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016332
410	NC_010470	TGA	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016332
411	NC_010470	GGT	2	6	18651	18656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016332
412	NC_010470	A	6	6	18672	18677	100 %	0 %	0 %	0 %	170016333
413	NC_010470	GGTT	2	8	18715	18722	0 %	50 %	50 %	0 %	170016333
414	NC_010470	GGAC	2	8	18742	18749	25 %	0 %	50 %	25 %	170016333
415	NC_010470	TGT	2	6	18804	18809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016333
416	NC_010470	GGT	2	6	18940	18945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016333
417	NC_010470	GTG	2	6	19044	19049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016333
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419	NC_010470	AGA	2	6	19225	19230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016333
420	NC_010470	T	7	7	19270	19276	0 %	100 %	0 %	0 %	170016333
421	NC_010470	TGA	2	6	19282	19287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
422	NC_010470	CAA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016333
423	NC_010470	GTC	2	6	19368	19373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016333
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426	NC_010470	GGGGT	2	10	19555	19564	0 %	20 %	80 %	0 %	170016333
427	NC_010470	T	6	6	19598	19603	0 %	100 %	0 %	0 %	170016333
428	NC_010470	TGA	2	6	19645	19650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
429	NC_010470	TAGT	2	8	19748	19755	25 %	50 %	25 %	0 %	170016333
430	NC_010470	AAGCA	2	10	19824	19833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
431	NC_010470	CTG	2	6	19872	19877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_010470	CTG	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_010470	TGG	2	6	19914	19919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_010470	C	6	6	20005	20010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
435	NC_010470	G	7	7	20023	20029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
436	NC_010470	CTC	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_010470	TAA	2	6	20118	20123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010470	TGA	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010470	TGA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016334
440	NC_010470	TTG	2	6	20344	20349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016334
441	NC_010470	AGG	2	6	20368	20373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016334
442	NC_010470	ATA	2	6	20410	20415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016334
443	NC_010470	ATG	2	6	20575	20580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
444	NC_010470	TGA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
445	NC_010470	AT	3	6	20655	20660	50 %	50 %	0 %	0 %	170016335
446	NC_010470	ATT	2	6	20705	20710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016335
447	NC_010470	T	6	6	20758	20763	0 %	100 %	0 %	0 %	170016335
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449	NC_010470	TGT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016335
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451	NC_010470	TGG	2	6	21126	21131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016335
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464	NC_010470	TGA	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
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499	NC_010470	T	6	6	23345	23350	0 %	100 %	0 %	0 %	170016339
500	NC_010470	GTT	2	6	23360	23365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016339

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